Vědecko - výzkumná činnost pracovníků katedry je zaměřena na produkční a stresovou fyziologii rostlin, floristické, vegetační a taxonomické studie. Katedra je (byla) zapojena do grantových projektů - GAČR, NAZV a také do řešení výzkumného záměru fakulty. Další výzkumné aktivity katedry jsou podporovány v rámci externích a interních grantů.