FURST, C. – VACIK, H. – LORZ, C. – MAKESHIN, F. – PODRÁZSKÝ, V. – JANEČEK, V. Meeting the challenges of process-oriented forest management. Forest Ecology and Management, 2007, roč. 248, č. 1, s. 1 - 5. ISSN: 0378-1127.
MAULEOVÁ, M. – VÍTÁMVÁS, J. Differential success of somatic embryogenesis in random gene pool of Norway spruce. Journal of Forest Science, 2007, roč. 53, č. 2, s. 74 - 87. ISSN: 1212-4834.
BAŽANT, V. Study of natural hybridization between Alnus incana (L.) Moench. and Alnus glutinosa (L.) Gaertn.. Journal of Forest Science, 2007, roč. 53, č. 2, s. 66 - 73. ISSN: 1212-4834.
JANEČEK, V. – KOBLIHA, J. Spontaneous hybrids within the genus Abies - growth and development. Journal of Forest Science, 2007, roč. 53, č. 5, s. 193 - 203. ISSN: 1212-4834.
KOBLIHA, J. – JANEČEK, V. Growth of Hybrid Clonal Material within Genus Abies. Zeszyty Naukove, 2007, roč. 439, č. 92, s. 63 - 74. ISSN: 0239-9342.
NAGEL, T. – SVOBODA, M. Regeneration patterns after intermediate wind disturbance in an old-growth Fagus-Abies forest in southeastern Slovenia. Forest Ecology and Management, 2006, roč. 226, č. 0, s. 268 - 278. ISSN: 0378-1127.
SVOBODA, M. – MATĚJKA, K. – KOPÁČEK, J. Biomass and elements pools of the selected spruce trees in the catchments of Plešné and Čertovo Lakes in the Bohemian Forest. Journal of Forest Science, 2006, roč. 52, č. 10, s. 471 - 485. ISSN: 1212-4834.
SVOBODA, M. – KOPÁČEK, J. – MATĚJKA, K. – PODRÁZSKÝ, V. CARBON POOLS IN MOUNTAIN NORWAY SPRUCE ECOSYSTEM IN THE BOHEMIAN FOREST (CZECH REPUBLIC). Lesnicky časopis (Forestry Journal), 2006, roč. 52, č. 1, s. 79 - 87. ISSN: 0323-1046.
ULBRICHOVÁ, I. – REMEŠ, J. – ZAHRADNÍK, D. Development of the spruce natural regeneration on mountain sites in the Šumava Mts.. Journal of Forest Science, 2006, roč. 10, č. 52, s. 446 - 456. ISSN: 1212-4834.
SVOBODA, M. – KOPÁČEK, J. – MATĚJKA, K. – ŽALOUDÍK, J. Estimation of tree biomass of Norway spruce forest in the Plešné Lake catchment, the Bohemian Forest. Biologia, 2006, roč. 61, č. 20, s. 523 - 532. ISSN: 0006-3088.
SVOBODA, M. – MATĚJKA, K. – KOPÁČEK, J. Biomass and element pools of understory vegetation in the catchments of Čertovo Lake and Plešné Lake in the Bohemian Forest. Biologia, 2006, roč. 61, č. 20, s. 509 - 521. ISSN: 0006-3088.
KOBLIHA, J. – JANEČEK, V. Development of Fir Hybrid Clonal Material. Journal of Forest Science, 2005, roč. 51, č. 51, s. 3 - 12. ISSN: 1212-4834.
PODRÁZSKÝ, V. – ULBRICHOVÁ, I. – KUNEŠ, I. – FOLK, P. Green alder effects on the forest soils in higher elevations. Journal of Forest Science, 2005, roč. 51, č. 0, s. 38 - 42. ISSN: 1212-4834.
KOBLIHA, J. – JANEČEK, V. Development of progenies from spontaneous hybrids within genus Abies. Communicationes Instituti Forestalis Bohemicae, 2005, roč. 22, č. 1, s. 53 - 60. ISSN: 1211-2992.
KUNEŠ, I. – ULBRICHOVÁ, I. Dynamics of spruce plantation after liming. Ekologia-Bratislava, 2003, roč. 22, č. 1, s. 167 - 170. ISSN: 1335-342X.
Odborná monografie
**NOVÁK, I. – **ZÁMEČNÍK, PH.D., I. – **MACHEK, I. – TRPÁKOVÁ, I. – **TRPÁK, R. – **REGNER, I. – **PAVLÍČKO, PH.D., I. – **KRAUSE, I. – GRULICH, J. – GDULOVÁ, K. – JANEČEK, V. – JANEČKOVÁ MOLNÁROVÁ, K. – KUPKA, J. Krajina pro chov a výcvik ceremoniálních kočárových koní v Kladrubech nad Labem. Praha: Národní zemědělské muzeum, 2022, 250s. ISBN 978-80-88270-33-1.
BALÁŠ, M. – BAŽANT, V. – BORŮVKA, V. – **DIMITROVSKÝ, K. – **FULÍN, M. – KUNEŠ, I. – KUPKA, I. – MELICHAROVÁ, L. – MONDEK, J. – PODRÁZSKÝ, V. – PRKNOVÁ, H. – RESNEROVÁ, K. – ŠÁLEK, L. – VACEK, O. – VACEK, Z. – ZEIDLER, A. Silvicultural, Production and Environmental Potential of the Main Introduced Tree Species in the Czech Republic. Praha: Lesnická práce s.r.o., 2019, 186s. ISBN 978-80-213-2993-5.
BAŽANT, V. – **ÚRADNÍČEK, L. Keře. Praha: Academia, 2018, 476s. ISBN 978-80-200-2777-1.
BÍLEK, L. – PEŇA, J. – REMEŠ, J. National Nature Reserve Voděradské bučiny – 30 years of forestry research. Kostelec nad Černými lesy: Lesnická práce, 2013, 86s. ISBN 978-80-7458-051-2.
ŠANTRŮČKOVÁ, H. – VRBA, J. – KŘENOVÁ, Z. – SVOBODA, M. – BENČOKOVÁ, A. – EDWARDS, M. – FUCHS, R. – HAIS, M. – HRUŠKA, J. – KOPÁČEK, J. – MATĚJKA, K. – RUSEK, J. Co vyprávějí horské smrčiny: Průvodce lesními ekosystémy Šumavy. Vimperk: Správa NP a CHKO Šumava, Přírodovědecká fakulta Jihočeské univerzity, Česká společnost pro ekologii, 2010. 153s. ISBN 978-80-87257-04-3.
VACEK, S. – MATĚJKA, K. – REMEŠ, J. – ULBRICHOVÁ, I. – SIMON, J. – TURČÁNI, M. – VIEWEGH, J. – BEDNAŘÍK, J. – MALÍK, K. – MALÍK, V. – BÍLEK, L. – ŠTÍCHA, V. – SEMELOVÁ, V. – EŠNEROVÁ, J. – BALÁŠ, M. Lesní ekosystémy v Národním parku Šumava. Kostelec nad Černými lesy: Lesnická práce, s.r.o., 2009. 512s. ISBN 978-80-87154-68-7.
VACEK, S. – KREJČÍ, F. – MATĚJKA, K. – PODRÁZSKÝ, V. – REMEŠ, J. – ULBRICHOVÁ, I. – ZATLOUKAL, V. – SVOBODA, M. – SIMON, J. – MINX, T. – JANKOVSKÝ, L. – TURČÁNI, M. – LEPŠOVÁ, A. – STARÝ, J. – VIEWEGH, J. – BEDNAŘÍK, J. – MALÍK, K. – BÍLEK, L. – ŠTÍCHA, V. – POUSKA, V. – EŠNEROVÁ, J. – JAKUŠ, R. – KOZEL, J. – MALÍK, V. – BALÁŠ, M. – SEMELOVÁ, V. Lesní ekosystémy v Národním parku Šumava. Kostelec nad Černými lesy: Lesnická práce, s.r.o., 2008. 512s. ISBN 978-80-87154-36-6.
Kapitoly v odborné knize
**PACH, M. – **SANSONE, D. – **PONETTE, Q. – **BARREIRO, S. – **MASON, B. – **BRAVO-OVIEDO, A. – SVOBODA, M. Managing forest ecosystems. Springer, Cham: Springer International Publishing AG, 2019, 420s. ISBN 978-3-319-91952-2. Silviculture of Mixed Forests: A European Overview of Current Practices and Challenges, s. 185-253.
**BRAVO-OVIEDO, A. – **PRETZSCH, H. – **DEL RÍO, M. – SVOBODA, M. Dynamics, Silviculture and Management of Mixed Forests. neuvedeno: Springer International Publishing AG., 2018, 412s. ISBN 978-3-319-91952-2. Silviculture of Mixed Forests: A European Overview of Current Practices and Challenges, s. 185-253.
ANGELSTAM, P. – ELBAKIDZE, M. – AXELSSON, R. – ČUPA, P. – HALADA, Ľ. – MOLNAR, Z. – PĂTRU-STUPARIU, I. – PERZANOWSKI, K. – ROZULOWICZ, L. – STANDOVAR, T. – SVOBODA, M. – TÖRNBLOM, J. The Carpathians: Integrating Nature and Society Towards Sustainability. : Springer, 2013, 717s. ISBN 978-3-642-12724-3. Maintaining Cultural and Natural Biodiversity in the Carpathian Mountain Ecoregion: Need for an Integrated Landscape Approach, s. 393-424.
NAGEL, T. – SVOBODA, M. – PANAYOTOV, M. Integrative approaches as an opportunity for the conservation of forest biodiversity. Freiburg: European Forest Institute, 2013, 284s. ISBN 978-952-5980-06-6. Natural disturbances and forest dynamics in temperate forests of Europe, s. 116-123.
MERGANIČOVÁ, K. – MERGANIČ, J. – SVOBODA, M. – BAČE, R. – ŠEBEŇ, V. Forest Ecosystems - More than Just Trees. Croatia: InTech publisher, 2012, 464s. ISBN 978-953-51-0202-1. Deadwood in forest ecosystems, s. 81-108.
