Od roku 2005 v souvislosti se zánikem Laboratoře rostlinných explantátů a zřízení Katedry jakosti a zpracování zemědělských produktů byla získána část rušeného přístrojového vybavení (flowbox a kultivační třepačka), a toto vybavení poskytlo základ pro realizaci rostlinných in vitro kultur. Práce navazovaly na projekt, který byl řešen s Výzkumným ústavem bramborářským Havlíčkův Brod s.r.o. a od této chvíle se laboratorní výzkum katedry mohl rozvíjet i po jiné linii, než po té molekulární. V roce 2006 byl v rámci projektu FRVŠ zakoupen buněčný manipulátor ECM 2000 (na obrázku vpravo nahoře), který umožňuje manipulace s buňkami rostlin, živočichů a bakterií. Ve vztahu k in vitro kulturám tak bylo získáno jedinečné vybavení pro šlechtitelskou aplikaci. První somatické hybridizace byly provedeny v roce 2007 a jejich výsledkem byly somatické hybridy dihaploidních klonů bramboru s donorem genů rezistence k plísni bramboru druhem Solanum bulbocastanum testované od roku 2008 ex vitro na školním demonstračním pozemku. Technika byla jako zdařilý výsledek mnohaměsíční práce začleněna do výuky předmětu Cytologie a karyologie, vybavení jako celek a výsledky práce jsou potom předmětem demonstračních cvičení a exkurzí v rámci předmětů s genetickou a šlechtitelskou tématikou. Zkušenosti s touto technikou byly též uplatněny formou krátké dynamické ukázky v prezentačním videoklipu Jsme živá univerzita (30. - 32. sekunda záznamu).
Katedra pro účely výzkumu získala skleníkovou kóji v nově zbudovaném skleníku v roce 2006. V roce 2010 prošel náročnou rekonstrukcí - vybavením klimatizací - financovanou Fakultou se spoluúčastí pracoviště. Skleník je využíván jak pro řešení výzkumných aktivit vyplývajících ze zadání grantových projektů, tak k demonstračním účelům v rámci pedagogických aktivit katedry a řešení studentských prací.